台研會與海洋先行者同行已有十多年的歷史。從2002年起，在時任教授、現為立委的邱文彥連結下，台研會便與海洋學界共同舉辦了跨部會、跨學校、跨領域的「海洋與台灣」綜合性研討會。在當時，這個模式是一項創舉。

　2009年及2014年，台研會延續這個模式，在三屆「海洋與台灣」的研討會上，總共發表論文七十多篇，包括中央研究院、國立台灣大學、國立海洋大學、國立成功大學、國立中山大學、國立高雄海洋科技大學、國立台東大學等與海洋有關的最具代表性的學術機構，幾乎精銳盡出。會場不論是在高雄或是在台北，參與者都非常熱烈，現場幾乎都是爆滿；尤其是到閉幕之前，有關「海洋宣言」或「行動綱領」的逐條逐字討論，也都非常認真，字字計較。那種場景，令人難以忘懷。

　2016年，台研會與國立海洋大學等共同舉辦第四屆海洋與台灣研討會，並發表「2016永續海洋行動呼籲」，同時強力籲請政府盡速成立已完成立法的海洋委員會。

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